fatal: this operation must be run in a work tree
fatal: 'git status --porcelain=2' failed in submodule client
 

git rm -r --cached 명령을 실행 후 git status에서 발생되는 에러입니다.

삭제 후 워킹 트리에서 하위 디렉토리 설정이 처리되지 못해서 발생됩니다.

하위 디렉토리에서 아래 명령 실행 후 다시 해보면 정상 동작됩니다.

git init